Bu sistem bildiğimiz mikrodalga fırınlarda olduğu gibi çalışır. Burada radyo dalgasına benzer nitelikte, belirli frekansda olan elektromanyetik dalgalar kullanılır. Bu frekansdaki radyo dalgaları içinde su, yağ ve şeker olan dokular tarafından absorbe edilir ve bu moleküllerde bir titreşim hareketine neden olur,titreşen moleküller bir birine sürtünerek ısı oluşturur bu ısı enerjisi de dokuda tahribat yapar. Bu sistemde diğer sistemlerden farklı olarak ısı enerjisi dokunun tümünde yaygın olarak oluşmakta kıl köküne özgü olmamaktadır. Mikrodalga yöntemin kıl kökü seçiciliği olmaması nedeniyle kıl kökünü tahrip edecek düzeyde ortaya çıkan ısı enerjisi belki kıl kökünü yok edebilir, ancak aynı zamandaderide bulunan diğer dokuları (kan damarları, ter ve yağ bezleri, deri altı bağdokusu ve elemanları) da tahrip edecektir. Özellikle göz için çok tehlikeli olabilecek riskler taşıdığından yüz bölgesi için kullanımı kesinlikle önerilmemektedir.
