Lazer epilasyon, tıp  teknolojisinin epilasyon uygulamalarında  geldiği en son düzey olmasına karşın, tıbbın her alanında olduğu gibi belli oranda riskleri ve yan etkileri de beraberinde taşımaktadır.

  Sanıldığı kadar basit ve %100 güvenli bir yöntem değildir.Ciddi oranda tecrübe, bilgi ve uzmanlık gerektiren bir uygulamadır.

  En sık karşılaşılan komplikasyon cilt yanıklarıdır. Özellikle koyu renk tenlilerde ve yüksek doz enerji uygulanan vakalarda görülmektedir.Ayrıca bronz tenlerde en fazla yanık riski taşıyanlardır.Ayrıca  lokal  anestezi veya ağrı kesici ile lazer epilasyon yaptıranlarda da yanık riski ciddi oranda yükselir.Neyse ki bu yanıkların çoğu  kalıcı olmayan birinci ve ikinci derece yanıklardır.

   Aşağıda tekniğine uygun yapılmayan  lazer epilasyon sonrası ortaya çıkan cilt yanıkları görülmektedir

 Yanık dışında en sık görülen yan etki, cilltte beyaz beneklenmelerdir.Özellikle esmer tenlilerde görülen bu komplikasyon, cilt içindeki serbest melaninin lazer ışınları tarafından yok edilmesi ile ortaya çıkar.Lazer probu çapında 10-12 mm lik alanda kaybolan pigment nedeniyle bu bölgede cilt rengi acılarak zımba ile delinmiş gibi cok sayıda benekler oluşur.Bunların çoğu 3 ay içinde kendiliğinden düzelmekle birlikte nadiren koyu tenlilerde kalıcı olabilir

       Lazer epilasyon sonrası ciltte hipopigmente benekler

 Yanık ve cilt rengindeki değişimler dışında lazer epilasyon uygulanan bölgeye göre bazı komplikasyonlar görülebilmektedir.Lazer özellikle göze çok zararlıdır, literaturde kaş bölgesinde lazer epilasyon yapılırken gözünde kalıcı olarak karatarakt ve görme bozukluğu gelişen 27 yaşında bir bayan hasta tanımlanmıştır.